Оно в ATMEGA одно - запрет прерываний при входе в любой вектор. Поэтому, если хочешь приоритетов надо сложную хрень писать - запомнить все текущие настройки прерываний, разрешить те которые тебе надо, не забыть всё восстановить и т.д. и т.п. Выделять таким образом 1-2 прерывания с повышенным приоритетом можно, больше - да ну его на ..
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)