На материнке бывает обычно только два варианта: по порядку и в шахматном порядке. Я обычно проверяю это простым способом - с помощью тестера ищу 5pin, который соединяется с общим проводом.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)