Если это 4-х точечный FSK например - то какой проблема? Ну а если двухчастотный - то можно например декодировать его в двух каналах со сдвигом по времени на 1 бит. Где лучше дела обстоят - там и угадал.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)