AVRstudio 3.56, в проекте ставится 3'd party compiler, как вызов компилятора ставится вызов runmake.bat (в нём перенаправления выдачи вызова make.exe), makefile надо сделать так, чтобы генерировался сразу coff и _одной_кнопочкой_ в AVRstudio можно скомпилировать проект и загрузить результат в симулятор. Сам ен пользуюсь, но паре человек настраивал.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)