В общем случае, если считать что PC имеет право произвольно писать на носитель, не понятно как вообще корректно заблокировать. Если со стороны хоста только чтение, то после блокировки все равно придется перемонтировать.

Интересно, вы писали про создание каталога, который появляется сразу. Предполагаю, что сразу он появляется как файловая запись в родительском каталоге, которая может быть перечитывается при обращении к этому родительскому каталогу (если забыть про кеширование). А вот помечен ли в самой таблице FAT на хосте его кластер, если хост не будет перечитывать таблицу?

Вообще ИМХО те еще игры, с учетом того что поведение файловой системы ОС хоста трудно предсказуемо. Хотя для конкретной конфигурацию оси и приложений хоста вариант поочередно доступа с неспешным переключением с блокировкой/перемонтированием организовать наверно можно.