Есть такая заморочка у PCAD.
Для хранения данных в библиотек - все виводы должны иметь номер (Pin numder).
Номера должны быть непрерывные и начинаться с 1.
Они используются только в библиотекаре, чтобы вывести в таблицу по порядку.

Если это обычный чип, то я вначале набиваю все ножки с номером совпадающим с обозначением Pin numder = Pin designstor = Pin Name.

Сохраняю элемент, а затем переименовываю Pin Name.
Если ножки "прорежены" или BGA корпус тогда, естественно numder != designstor.