Неа, не аналогично. Счёт-фактура - это не счёт. А плащ-паталка - составное назавние. Тут как раз как хотишь, так и называй. И вообще ситуацию диктует плательщик. РЖД, ,а видимо, и гос-е структуры для себя решили - женский род. Так оно и будет ибо научных обоснований никаких быть не может. Это как проезд 4-мя тачками перекрестка равнозначных дорог - надо договориться.