конечно, PnP решает массу проблем, но не все. К тому же, "не боги горшки обжигают", и в реализации железок всегда есть ошибки, вопрос только в том, насколько критические и где они себя проявят.

Биос видеокарт нужен не только для int 10h, он нужен ещё и как минимум для начальной инициализации оборудования. Вполне возможно, её могли бы делать и загружаемые драйвера, но в отличие от большинства другого PCI-оборудования видеокарта является, так сказать, "жизненно необходимым" устройством, поэтому переложить инициализацию полностью на драйвер нельзя. А системы с несколькими видеокартами вообще относительно редки, поэтому иногда вопросам корректной работы в такой конфигурации не уделяется должного внимания

Я не проводил специальных исследований по данному вопросу. Но я реально сталкивался 1 раз с полной неработоспособностью PCI-видеокарт в плате с AGP (при этом в той же плате работали PCI-модем, сетевая плата и саунд), несколько раз с неработоспособностью двух PCI-видео одновременно, а также с невозможностью работы AGP/PCIe видеокарты с чипсетовской
Скажем так, неудачный опыт составлял примерно 1/3 от удачного