в каждом канале 8 бит счетчиков на входную и опорную частоту. Тактировать от микроконтроллера частотой 250 кГц. Итого - 64 триггера. Плюс ворота, другие накладные расходы, SPI интерфейс - пусть еще 20 триггеров. В EPM3128ATC100-10 всё влезет. Это примерно 5$.