ШАГ2:
В той-же директории "PartDescriptionFiles" находится файлик avrdragonparts.сас - тоже представляющий из себя XML файл. Его кстати можно удалять, он создается заново для дивайсов в которых есть тэг "AVRDragon". Этот файлик отличается от файла "jtagmkIIparts.cac" только тем, что в нем дополнительно прописан размер флэша для кристаллов (в XmlShell очень наглядно...)
Так вот, если прописать туда цифирьку <=32768, то кристалл появляется в списке при запуске отладчика в "Project vizard"...