Где здесь Вы увидели необходимость серьёзной обработки сигнала? Кулер - чрезвычайно медлительный и инерционный агрегат (с точки зрения МК), отследить последовательность сигналов его тахометра проще простого. Последовательность его импульсов будет предугадываться на секунду вперёд с хорошей точностью.

Однако в данном случае я сам постарался бы сделать большую частоту и маленький фильтр.

А вообще, я заметил, что люди делятся на два класса - те, кто всю сложность пытается по возможности загнать в софт, и те, кто предпочитает реализовывать все фичи по максимуму в железе. Это сродни религиозной войне. Хотя уверен, что в конце концов первые останутся, а вторые вымрут как динозавры. Желаю Вам не отстать от эволюции! :)