STR911 - если инициализация PLL происходит сразу после рестарта, наблюдаются проблемы с подключением по JTAG (подключается путем зад**чивания с 10-20 раза, обычно на пониженной частоте JTAGа). Лечится добавлением небольшой задержки (десятки-сотни мсек) перед настройкой PLL. Описано в ерратах.
STM32 - после установки лок-битов на чтение (загрузка через уарт) подключиться по JTAG или SW невозможно - выдаёт какую-то ошибку ядра Cortex (не помню точно что именно). В отличие от STR91 здесь стирание всего чипа через JTAG почему-то не помогает. Лечится подключением через уарт (и встроенный ВООТлоадер) и стиранием через него.