1. Приёмопередатчики CAN практически все выдерживают не сгорая до 40 Вольт помехи относительно общего провода, а приёмопередатчики RS-485 только недавно появились с такими характеристиками.

2. CAN проще в реализации, поскольку у него аппаратный арбитраж и подтверждение доставки - он ещё на аппаратном уровне гарантирует, что посылку получат либо все правильно, либо никто. У RS-485 приходится трахаться с переключением направления приёма - во время передачи нужно следить, чтобы после передачи последнего байта незамедлительно переключиться в приём. Это доставляет некоторые неудобства.

3.Посылка CAN - только 8 байт ID (11 или 29 бит), а по RS-485 можно гнать более длинные посылки.

4. На RS-485 приходится делать систему master-slave, следовательно, датчики можно только циклически опрашивать. А на CAN любой из датчиков в любое время может крикнуть о том, что у него значение поменялось - опять же проще в реализации сбора данных.