Output controller TIOA запрограммировал следующим образом:
По SWTRG - SET
По CMPC - CLEAR
Остальное - NONE

В обработчике прерывания от PIT с частотой 10 Гц подаю SYNC (SWTRG) и поднимаю ещё одну ногу, которую роняю в обработчике прерывания от CMPC. Так вот, TIOA поднимается в 1 спустя ровно один период, а не мгновенно по SWTRG, как этого можно было бы ожидать, глядя на схему устройства канала.

Т.е. RESET у этой скотины синхронный и запаздывающий!