Кусок Main.h:

#define ENC_F2   (1 << PC0) //IL - фаза энкодера F2
#define ENC_F1   (1 << PC1) //IL - фаза энкодера F1

#define Pin_ENC_F2    (PINC & ENC_F2)
#define Pin_ENC_F1    (PINC & ENC_F1)

Encoder.h:

#ifndef EncoderH
#define EncoderH

#define ENC_UP  0x01
#define ENC_DN  0x02

void Encoder_Init(void);         //инициализация энкодера
void Encoder_Exe(void);          //обработка энкодера

#endif