1) если это что то типа сервера, и можно работать только в RAM, то после загрузки перемонтировать всякие рабочие папки в раму и спокойно жить, а при завершении сгружать их содержимое на диск.

2) есть специальный драйвер прослойка для работы с Flash дисками, он при записи на сектор/кластер, каждый раз перемещает его на новое место, так чтоб число циклов записи в каждый сектор было одинаково, это резко продляет жизнь Flash-кам.