окна отрисовываться будут. В особо тяжелых случаях, когда ваша задача хапает 100% расчетного времени, весьма полезно нарисовать пользователю "градусник" с процентом выполнения задачи и временами отдавать управление этой функции. "Градусник" будет шевелиться. Да и остальным окошкам полегчает, пока вы там со своими данными разберетесь.