какие-то полезные куски прерывания таймера по условию вызывать до или после этого требовательного поллинга, в зависимости от того, есть ли время на их исполнения. Чтобы не совсем под хвост это время. А так больше вариантов нет физически, кроме разве что использования чего-то железного, что делает этот поллинг, например DMA-канала, синхронизированного с таймером.