Ответ: Тоже самое и в симуляторе...Например я узнал, что AVR Studio не корректно работает с таймерами в Fast PWM режимах (счётчик продлжает считать а не сбрасывается при достижения значения, записанного в регистре сравнения)..Яэто узнал и продолжил отладку в симуляторе дальше