Компактность - а в чем перспектива? устройства хранения данных сейчас весьма дешевы и дешевеют на глазах (я не говорю сейчас о встраиваемых системах, речь идет home PC)
Меньшее потребление ресурсов - тут спорно. Если GUI включен на обоих системах, то потребление примерно одинаково. Однако можно пожертвовать потреблением памяти, например, в угоду производительности.
Конфигурируемость-тут я бы сказал "простота конфигурируемости", т.к. в винде много чего можно сконфигурировать только через реестр.

А вот по части подсистемы ввода-вывода и драйверов, в Винде она мне показалась гораздо более продумана чем в Linux. Основные проблемы только с закрытостью архитектуры и хреновой документацией.