хороший пример как получить двухполярный выход. Дальше используя эту идею строится твой контроллер.
По поводу падений. Все фазы имеют разброс тока ~ 15% (проверено на опыте, при одинаковой скважности шима разброс идет из за параметров индуктивностей ). Так что падение надо считать не на токе 500А, а на токе 25А, что получается вполне приемлемо.
По поводу прелести многофазных источников. Каждая фаза имеет независимую защиту от перегрева и перегрузок, с ограничением выходного тока. Конструктивно подобную балалайку лучше выполнять как модуль из 2-х фаз. И монтировать все на выходных шинах, будет всего ~ 30 силовых модулей + модуль управления. Все это загоняется в ящик с принудительным охлаждением.

По поводу последнего совета в треде - что можно не шимить одну половинку моста - это сделать трудно, именно из за больших токов. Модули с шимом балансируют нагрузку между собой, даже при различном подводящем сопротивлении. Потому что модуль фактически выдает ток, а не напряжение или сопротивление. Это обратная связь превращает выход по току в выход по напряжению. Просто ключи на такие токи сделать трудно.