Один раз можно. Новый прошить и установить фузы генератора CKOPT=1 CKSEL3..1=111 (см. раздел "Crystal Oscillator", стр 25 doc2486.pdf от Atmel - ДШ на Мегу8). После этого без внешнего источника тактирования (напр. кварца, генератора) программатор КодеВижена его больше не увидит :) Пользуйся программатором AVReal и такой проблемы не будет - он может сам выдавать тактовую при программировании.