Вторую систему (хоть 98ю, хоть Линукс, хоть QNX беспроблемнее всего разворачивать в виртуальной машине. VirtualPC, либо WmWare. Работает - полный вперед! Вплоть до нормальной работы в виртуальной 98-й винде ДОСовского программатора, который напрямую лезет в принтерный порт.