Если преобразование HEX-BIN выполняется в устройстве, то тот же TeraTerm Вам поможет. Засылать файл через меню "File" - "Send file...", задержку выставлять в "Setup" - "Serial port...". Если нужно, чтобы передавался бинарник, то придется написать/найти утилиту, а при передаче в окошке выбора файла установить галку "Binary"