АТмега запускается от 3 вольт с фузом CKDIV8, далее своим пином генерит меандр и конденсаторами и диодами повышает своё напряжение до 5 вольт. Когда увидит, что напряжение питания выросло и стабилизировалось, выключает внутреннее деление частоты. Теперь с ножки CLKOUT снимаете её тактовый клок 20 МГц для циклона.