"Компилятор AVR Studio" называется AVR Assembler или AVR Assembler 2, это самостоятельное консольное приложение. Вся документация содержится в файле %windir%\HELP\AVRASM.chm, недописанное там - в доках по разнообразным ассемблерам, общих принципов которых придерживаются разработчики
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)