Не совсем так, кристаллы используются действительно одинаковые, просто что бы разработчик мог ориетироваться, их заливают в цилиндричиские заготовки, в дальнейшем для отрицательных напряжений корпус стачивают с одной стороны для положительных с другой. Это для ТО-92 для других корпусов думаю что то делают аналогичное.
(«Телесистемы»: Конференция «Микроконтроллеры и их применение»)