Ее никак выключать не надо. Просто не используй. Притяни через резистор к +3.3. А Chip select для своих девайсов генерируй GPIO-шными ногами. Если твои девайсы работают только на прием - то тебе счастье: приемную часть McBSP устанавливаешь в ресет и используешь как GPIO: FSR и CLKR как выходы, но вот 3-й пин придеться выискивать.